C’est sous un ciel serein qu’éclata la première crise dans les rapports Mali-Burkina Faso. Elle fut appelée «Affaire Drissa Keïta». Ancien ministre malien des Finances et du Commerce, Secrétaire général de la Communauté économique de l’Afrique de l’Ouest (CEAO), Drissa Keïta, parce qu’il avait fait une déclaration bénigne sur les révolutions en général, il a été déclaré personne non grata au Burkina Faso et expulsé, sans que les autorités maliennes aient été prévenues, conformément aux textes en vigueur à la CEAO.
Le Burkina Faso, à cause de la nationalité du Secrétaire général de la CEAO, a voulu traiter de manière bilatérale cette affaire qui, somme toute, concerne le Secrétaire général d’une institution régionale à savoir, la CEAO. Sous le mandat de Thomas Sankara à la présidence de la CEAO, le siège du Secrétaire général est resté vacant, la communauté ayant été paralysée par cet incident.